Alphys wygląda na grubą i przygarbioną. Ma ona pomarańczowo-żółtą skórę i nosi biały fartuch ( na specjalne okazje zakłada sukienkę w kropki) oraz okulary. Jest podobnej wysokości co gracz.

Alphys jest mądrym i nieśmiałym potworem, który uwielbia anime i mangę. Podczas rozmów często jąka się oraz rozwesela na myśl o obserwowaniu wędrówki Frisk za pomocą kamer rozmieszczonych w Podziemiach. Naukowiec darzy Undyne uczuciem, które uważa za nieodwzajemnione, jednak okazuje się to nieprawdą w czasie Prawdziwej Pacyfistycznej Ścieżki. Wiadomo także, że czuje ona także coś do Asgore'a, czego można dowiedzieć się z quizu Mettatona. Potwór jest zamknięty w sobie z powodu poczucia winy i niepewności co do swoich dokonań. W szczególności jest ona odpowiedzialna za nieumyślnie nieudane eksperymenty Flowey'ego i Amalgamatów. Tajemnica ta zostaje ukazana w Prawdziwym Laboratorium.